Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms