Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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