Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms