Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF1Q9UH73 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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