Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms