Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms