Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms