Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms