Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENOMQ8WWX9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms