Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms