Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HP1BP3Q5SSJ5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HP1BP3Q5SSJ5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms