Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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HIST3H3Q16695 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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HIST3H3Q16695 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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HIST3H3Q16695 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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HIST3H3Q16695 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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HIST3H3Q16695 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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