Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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