Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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