Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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CBFBQ13951 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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CBFBQ13951 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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CBFBQ13951 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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CBFBQ13951 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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CBFBQ13951 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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CBFBQ13951 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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