Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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