Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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