Protein–RNA interactions for Protein: Q08881

ITK, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITKQ08881 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITKQ08881 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITKQ08881 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITKQ08881 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITKQ08881 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITKQ08881 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITKQ08881 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITKQ08881 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITKQ08881 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITKQ08881 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITKQ08881 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITKQ08881 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITKQ08881 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITKQ08881 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITKQ08881 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms