Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms