Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM193AP78312 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms