Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TUBA4AP68366 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TUBA4AP68366 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TUBA4AP68366 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TUBA4AP68366 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TUBA4AP68366 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TUBA4AP68366 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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