Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms