Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms