Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCGF2P35227 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCGF2P35227 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCGF2P35227 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCGF2P35227 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCGF2P35227 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCGF2P35227 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCGF2P35227 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms