Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms