Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JRKO75564 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JRKO75564 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JRKO75564 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JRKO75564 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JRKO75564 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JRKO75564 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JRKO75564 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JRKO75564 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JRKO75564 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JRKO75564 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JRKO75564 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JRKO75564 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JRKO75564 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
JRKO75564 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms