Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.1 ms