Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PRAMEF25A6NGN4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PRAMEF25A6NGN4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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