Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms