Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXSMQ9NWU1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms