Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms