Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms