Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPR78Q96P69 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPR78Q96P69 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPR78Q96P69 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPR78Q96P69 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPR78Q96P69 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPR78Q96P69 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPR78Q96P69 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPR78Q96P69 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPR78Q96P69 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPR78Q96P69 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPR78Q96P69 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPR78Q96P69 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms