Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.9 ms