Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD42Q8N9B4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms