Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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