Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms