Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms