Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms