Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms