Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLMP48507 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms