Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms