Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SYT1P21579 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT1P21579 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT1P21579 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms