Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms