Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms