Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms