Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DCAF1Q9Y4B6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms