Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
MAPRE3Q9UPY8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAPRE3Q9UPY8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms