Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms