Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms